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Text File  |  1995-03-04  |  2.7 KB  |  53 lines
  1. ***************************************************
  2. * Vertebrate galactoside-binding lectin signature *
  3. ***************************************************
  4.  
  5. All vertebrates  synthesize  soluble  galactoside-binding  lectins [1,2] (also
  6. known  as  galaptins or S-lectin).  These  carbohydrate-binding  proteins  are
  7. developmentally regulated.  Although their exact physiological role is not yet
  8. clear they  seem to be  involved in differentiation,  cellular regulation  and
  9. tissue construction. The sequence of galactoside-binding lectins from electric
  10. eel  (electrolectin),  conger eel  (congerin) [3],  chicken  and  a  number of
  11. mammalian  species  is  known.  These lectins are proteins of about 130 to 140
  12. amino acid residues (14 Kd to 16 Kd).
  13.  
  14. A number of other proteins are known to belong to this family:
  15.  
  16.  - Caenorhabditis  elegans  32  Kd  lactose-binding lectin [4]. This lectin is
  17.    composed of two galaptin domains.
  18.  - The  MAC-2  antigen  (also known as CBP-35 or IgE-binding protein), a 35 Kd
  19.    lectin which  binds  immunoglobulin  E  [5]  and  which  is composed of two
  20.    domains: a  N-terminal  domain that consist of tandem repeats of a glycine/
  21.    proline-rich sequence and a C-terminal galaptin domain.
  22.  - Human eosinophil lysophospholipase (EC 3.1.1.5) [6] (Charcot-Leyden crystal
  23.    protein), a   protein  that  may  have  both  an  enzymatic  and  a  lectin
  24.    activities. It   forms   hexagonal  bipyramidal  crystals  in  tissues  and
  25.    secretions from sites of eosinophil-associated inflammation.
  26.  
  27. One of the conserved regions of these lectins  contains a  tryptophan that has
  28. been shown [7] to be essential  to the binding of galactosides.  We  have used
  29. this region as a signature pattern for these proteins.
  30.  
  31. -Consensus pattern: W-[GEK]-x-[EQ]-x-[RE]-x(3,4)-[PCT]-[LIVMF]-[QESK]-x-G-
  32.                     x(3)-[DEK]-[LIVMFC]
  33.                     [W binds carbohydrate]
  34. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  35. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  36. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  37.  
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  53.